Entre las actuaciones se incluyen el rescate y traslado de fauna durante los vaciados controlados, el seguimiento de flora y fauna, el control de la calidad del agua y la realización de inventarios de lodos.

En 2024, la Confederación Hidrográfica del Guadiana presentó la solicitud para iniciar la tramitación del procedimiento para llevar a cabo una intervención centrada en la erradicación del nenúfar mexicano en la cuenca del Guadiana.